Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp6P97868 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms