Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms