Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms