Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Prop1P97458 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prop1P97458 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Prop1P97458 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prop1P97458 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prop1P97458 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prop1P97458 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms