Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms