Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms