Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx1P82976 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms