Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CiitaP79621 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CiitaP79621 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms