Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp7P70280 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms