Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stra8P70278 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms