Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hspd1P63038 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hspd1P63038 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms