Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba52P62984 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba52P62984 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms