Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms