Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2bP62915 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms