Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms