Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vsnl1P62761 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vsnl1P62761 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms