Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl18aP62717 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl18aP62717 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms