Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms