Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup43P59235 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup43P59235 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms