Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl3P58873 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms