Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm2P58774 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms