Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn4P58404 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Strn4P58404 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Strn4P58404 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn4P58404 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Strn4P58404 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms