Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Dpf3P58269 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf3P58269 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms