Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpdl3bP58242 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms