Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp3P57722 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp3P57722 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms