Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c40P56657 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms