Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf5P56477 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf5P56477 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf5P56477 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf5P56477 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms