Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aqp4P55088 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms