Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GemP55041 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GemP55041 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GemP55041 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GemP55041 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GemP55041 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GemP55041 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GemP55041 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms