Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad23bP54728 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms