Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms