Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XpcP51612 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XpcP51612 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XpcP51612 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XpcP51612 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XpcP51612 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XpcP51612 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XpcP51612 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XpcP51612 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XpcP51612 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XpcP51612 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XpcP51612 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XpcP51612 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XpcP51612 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms