Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd7P50283 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms