Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc3P49135 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms