Protein–RNA interactions for Protein: P47879

Igfbp4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp4P47879 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp4P47879 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igfbp4P47879 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms