Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igfbp3P47878 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igfbp3P47878 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms