Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms