Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmx3P42581 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmx3P42581 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms