Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sept1P42209 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms