Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf9P41274 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms