Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp9P41245 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Mmp9P41245 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Mmp9P41245 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Mmp9P41245 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Mmp9P41245 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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