Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf3rP40223 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms