Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab17P35292 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab17P35292 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms