Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab6aP35279 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab6aP35279 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms