Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoc1P34928 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc1P34928 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms