Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pola1P33609 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola1P33609 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola1P33609 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms