Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd1P33215 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd1P33215 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd1P33215 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd1P33215 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd1P33215 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd1P33215 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd1P33215 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd1P33215 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd1P33215 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms