Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa11P31311 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms