Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc10P31257 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms