Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms